Sahara se nalazi u sjevernoj Africi, na zapadu je njena granica Atlantski okean, na sjeveru to su Atlaske planine i Sredozemno more, na istoku Crveno more i Egipat, na jugu Sudan i dolina rijeke Niger.

Najviši vrh je Emi Kusi, čija je visina 3.415 m, a nalazi se na južnoj strani planine Tibesti.

Sahara ima aridnu klimu, ali nije oduvijek bilo tako. Nekada je vladala vlažna klima, vegetacija je bila bujna, kiše su bile česte, a danas je ona jedno od najsušnijih predjela na svijetu. Prosječna dnevna temperatura kreće se od 35 do 55 C, a temperatura pijeska dostiže i 81 C.

Kroz Saharu protiče rijeka Nil, koja je jedna od dvije najduže rijeke na Zemlji. Što se tiče biljaka, u središtu pustinje nema nikakve vegetacije, u priobalnim područjima javljaju se žbunoliko rastinje, makija, lišajevi, a u podgorinama planina Ahagar i Tibesti mogu se vidjeti palme.

Jednogrba kamila i domaća koza najzastupljenije su životinje u Sahari. Takođe, ovdje žive i škorpije, pustinjska lisica, damani (mali sisari nalik glodarima), adaks antilope, afrički divlji psi, gepardi, a u kamenitim djelovima nalazi se nekoliko vrsta otrovnih zmija.